📄 evolutionary biology

Misleading inference of schistosome epidemiology from ribosomal internal transcribed spacer (ITS) and mitochondrial DNA

تُظهر هذه الدراسة أن الاعتماد على مؤشرات ITS وcox1 لاستنتاج الإصابات حيوانية المنشأ والتهجين الحديث بين بلهارسيا البول (*Schistosoma haematobium*) وبلهارسيا الماشية هو أمر مضلل، حيث يكشف تسلسل الجينوم أن هذه المؤشرات لا تعكس بدقة المستويات المنخفضة الفعلية لأسلاف الماشية في الطفيليات البشرية.

Enabuele, E. E., Platt, R. N., Adeyemi, E. E., Aisien, M. S. O., Ajakaye, O. G., Ali, M. U., Amaechi, E. C., Atalabi, T. (…)2026-05-05
📄 evolutionary biology

The lack of simplicity in sequence-fitness relationships

تجادل هذه الورقة بأن التفاعلات المحلية ذات الرتب العليا، والتي يمكن اكتشافها من خلال طرق ترتيب الرتب ومؤشر جديد يسمى "الأهرامات ثنائية الهرم الموقعة"، توفق بين النتائج المتضاربة حول تعقيد علاقات التسلسل واللياقة في العمليات التطورية مثل مقاومة مضادات الميكروبات.

Crona, K., Greene, D.2026-05-05
📄 evolutionary biology

Genome-wide architecture of prolonged starvation adaptation in experimentally evolved Drosophila and comparative enrichment in human orthologs

من خلال 60 جيلاً من التطور التجريبي في ذبابة الفاكهة (*Drosophila melanogaster*)، تكشف هذه الدراسة أن التكيف مع الجوع المطول يتضمن إعادة هيكلة جينومية واسعة النطاق ومتوازية تتركز حول مسارات الميتوكوندريا وإشارات TOR/S6K، مع إظهار الأشكال المتماثلة البشرية لهذه الجينات المختارة إثراءً كبيراً للمتغيرات المتمايزة في الجماعات الطبيعية.

Yadav, G., Mishra, P., Sahu, R. K., Sharma, V., Michalak, P., Aggarwal, D. D.2026-05-05
📄 evolutionary biology

Parallel evolution of full-length genomes in a long-term evolution experiment with phage ΦX174

من خلال الجمع بين تسلسل عالي الإنتاجية وتجارب التطور طويل الأمد على العاثية ΦX174، اكتشف الباحثون أن المجموعات المستقلة طورت بشكل متكرر جينومات كاملة الطول بدلاً من مجرد طفرات في موقع واحد، وهو نمط مدفوع بالانتخاب لا بالحياد، مما يؤثر بشكل كبير على تحليلات الهجرة في علم تطور السلالات القياسي.

Bons, E., Chabas, H., MacDonald, H., Escalera Ledermann, A., Dunstan, J., Ochsner, N., Angst, D. C., Bonhoeffer, S., Reg (…)2026-04-30
📄 evolutionary biology

First report of stop codon reassignment to tryptophan in members of the bacterial phylum Actinomycetota

تُبلغ هذه الدراسة عن أول اكتشاف لإعادة تعيين كودون التوقف UGA إلى التريبتوفان في شعبة الأكتينوميسيتوتا البكتيرية، وتحديداً ضمن فصيلة إيغرتيليس، حيث تكشف الأدلة الجينومية من المتعايشات المعوية للثدييات عن حدثين تطوريين مستقلين مرتبطين بالتعايش الإلزامي واقتراح ثلاثة أجناس جديدة.

Parks, D. H., Chaumeil, P.-A., Chuvochina, M., Hugenholtz, P.2026-04-30
📄 evolutionary biology

Experimental evolution to thermal stress indicates climate resilience in a cosmopolitan arthropod

تُظهر هذه الدراسة، من خلال التطور التجريبي والتحليلات متعددة الأوميكس، أن عثة ظهر الماس تتكيف بسرعة مع البيئات الحرارية المتباينة عبر طفرات جينية منسقة، وتنظيم فوق جيني، وإعادة برمجة أيضية، مما يؤكد مرونتها الكبيرة تجاه تغير المناخ.

Lei, G., Zhou, H., Ma, Z., Duan, Y., Chen, Y., Yao, F., You, M., Vasseur, L., Gurr, G. M., You, S.2026-04-30
📄 evolutionary biology

Getting a head: Evidence for a conserved anterior head patterning gene network in arthropods

تُظهر هذه الدراسة أن شبكة جينية محفوظة تشمل جينات *hedgehog* و*orthodenticle* و*odd-paired* تنظم تقسيم الرأس الأمامي في كل من العناكب والحشرات، مما يشير إلى أصل تطوري قديم لآلية التشكيل هذه رغم الاختلافات في تكوين القطع.

Cocker, B. M. J., Peel, A. D.2026-04-29
📄 evolutionary biology

Eco-evolutionary dynamics and environmental detoxification jointly shape bacterial community response to antibiotic perturbation

تُظهر هذه الدراسة أن تاريخ استخدام المضادات الحيوية يعيد تشكيل استجابات المجتمعات البكتيرية من خلال تغذيات راجعة بيئية وتطورية-بيئية مقترنة، حيث يعمل التهيؤ للمقاومة كعازل ضد الاضطراب الفوري عبر المقاومة المتطورة وإزالة السموم البيئية، ولكنه يعزز في النهاية الهيمنة التنافسية، مما يخلق مقايضة تحد من تنوع المجتمع وقدرته على التعافي.

Cairns, J., Smolander, N., Pausio, S., Pitkänen, O., Lindqvist, M., Tamminen, M., Das Roy, R., Friman, V.-P., Becks, L. (…)2026-04-29
📄 evolutionary biology

Constitutive and inducible fibrosis explain immune variation among threespine stickleback populations

من خلال الجمع بين مسح مناعي في البرية وتجربة حديقة شائعة، تكشف هذه الدراسة أن كلاً من التليف التأسيسي الوراثي والتليف المستحث المتأثر بالبيئة يدفعان التباين المناعي الخاص بالمجموعات في سمك الشبوط ذو الأشواك الثلاثية، مما يربط دفاعها ضد *Schistocephalus solidus* بالاختلافات البيئية في إثراء البحيرات.

Choi, E., Flanagan, B. A., Alexander, H., Berini, J., Yeung, A., Wolf, C. J., Watts, V., Vaziri, G., Vargas, N., Szajada (…)2026-04-29
📄 evolutionary biology

PhytClust: Efficient and Optimal Monophyletic Partitioning of Rooted Phylogenetic Trees

يُعد PhytClust خوارزمية جديدة خالية من العتبات، توفر طريقة فعالة ومثلى لتقسيم الأشجار الوراثية العرقية ذات الجذور إلى مجموعات أحادية الأصل عبر تقليل التشتت داخل المجموعات، مما يظهر تفوقاً في السرعة والدقة والقابلية للتوسع عبر مجموعات البيانات البيولوجية المتنوعة.

Ganesan, K., Billard, E., Kaufmann, T. L., Strange, C. B., Cwikla, M. C., Altenhoff, A. M., Dessimoz, C., Schwarz, R. F.2026-04-27